Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CATSPER4Q7RTX7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms