Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms