Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms