Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms