Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms