Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVM7

TOM1L2, TOM1-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1L2Q6ZVM7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TOM1L2Q6ZVM7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOM1L2Q6ZVM7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOM1L2Q6ZVM7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOM1L2Q6ZVM7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOM1L2Q6ZVM7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOM1L2Q6ZVM7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOM1L2Q6ZVM7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TOM1L2Q6ZVM7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOM1L2Q6ZVM7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOM1L2Q6ZVM7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOM1L2Q6ZVM7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOM1L2Q6ZVM7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOM1L2Q6ZVM7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOM1L2Q6ZVM7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOM1L2Q6ZVM7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOM1L2Q6ZVM7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOM1L2Q6ZVM7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOM1L2Q6ZVM7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOM1L2Q6ZVM7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TOM1L2Q6ZVM7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOM1L2Q6ZVM7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TOM1L2Q6ZVM7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOM1L2Q6ZVM7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOM1L2Q6ZVM7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOM1L2Q6ZVM7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOM1L2Q6ZVM7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOM1L2Q6ZVM7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOM1L2Q6ZVM7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms