Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBM43Q6ZSC3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms