Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00575Q6W349 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms