Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VITQ6UXI7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VITQ6UXI7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VITQ6UXI7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VITQ6UXI7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VITQ6UXI7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VITQ6UXI7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VITQ6UXI7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VITQ6UXI7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VITQ6UXI7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VITQ6UXI7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VITQ6UXI7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VITQ6UXI7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VITQ6UXI7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VITQ6UXI7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VITQ6UXI7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VITQ6UXI7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VITQ6UXI7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VITQ6UXI7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VITQ6UXI7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VITQ6UXI7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VITQ6UXI7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VITQ6UXI7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VITQ6UXI7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VITQ6UXI7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VITQ6UXI7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VITQ6UXI7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VITQ6UXI7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VITQ6UXI7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VITQ6UXI7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VITQ6UXI7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VITQ6UXI7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VITQ6UXI7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VITQ6UXI7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VITQ6UXI7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms