Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms