Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms