Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CARMIL2Q6F5E8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CARMIL2Q6F5E8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms