Protein–RNA interactions for Protein: Q6A163

KRT39, Keratin, type I cytoskeletal 39, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT39Q6A163 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT39Q6A163 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT39Q6A163 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT39Q6A163 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT39Q6A163 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT39Q6A163 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT39Q6A163 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT39Q6A163 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT39Q6A163 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms