Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms