Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9BQ674R7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG9BQ674R7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms