Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms