Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AGAP9Q5VTM2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AGAP9Q5VTM2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AGAP9Q5VTM2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AGAP9Q5VTM2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AGAP9Q5VTM2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AGAP9Q5VTM2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AGAP9Q5VTM2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AGAP9Q5VTM2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AGAP9Q5VTM2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
AGAP9Q5VTM2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AGAP9Q5VTM2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
AGAP9Q5VTM2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AGAP9Q5VTM2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AGAP9Q5VTM2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AGAP9Q5VTM2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AGAP9Q5VTM2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AGAP9Q5VTM2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AGAP9Q5VTM2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AGAP9Q5VTM2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms