Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C10orf55Q5SWW7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms