Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH76

XKR4, XK-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR4Q5GH76 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
XKR4Q5GH76 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
XKR4Q5GH76 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XKR4Q5GH76 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XKR4Q5GH76 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XKR4Q5GH76 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XKR4Q5GH76 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XKR4Q5GH76 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XKR4Q5GH76 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XKR4Q5GH76 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XKR4Q5GH76 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
XKR4Q5GH76 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XKR4Q5GH76 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XKR4Q5GH76 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XKR4Q5GH76 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XKR4Q5GH76 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XKR4Q5GH76 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XKR4Q5GH76 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XKR4Q5GH76 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XKR4Q5GH76 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XKR4Q5GH76 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XKR4Q5GH76 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
XKR4Q5GH76 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XKR4Q5GH76 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XKR4Q5GH76 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms