Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF542PQ5EBM4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF542PQ5EBM4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF542PQ5EBM4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF542PQ5EBM4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF542PQ5EBM4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF542PQ5EBM4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF542PQ5EBM4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF542PQ5EBM4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF542PQ5EBM4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF542PQ5EBM4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF542PQ5EBM4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF542PQ5EBM4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF542PQ5EBM4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF542PQ5EBM4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF542PQ5EBM4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF542PQ5EBM4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF542PQ5EBM4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF542PQ5EBM4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF542PQ5EBM4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF542PQ5EBM4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF542PQ5EBM4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF542PQ5EBM4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF542PQ5EBM4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF542PQ5EBM4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF542PQ5EBM4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF542PQ5EBM4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF542PQ5EBM4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF542PQ5EBM4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF542PQ5EBM4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF542PQ5EBM4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF542PQ5EBM4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF542PQ5EBM4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms