Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL39P5Q59GN2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms