Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SDK2Q58EX2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SDK2Q58EX2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SDK2Q58EX2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SDK2Q58EX2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SDK2Q58EX2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SDK2Q58EX2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SDK2Q58EX2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SDK2Q58EX2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SDK2Q58EX2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SDK2Q58EX2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SDK2Q58EX2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SDK2Q58EX2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SDK2Q58EX2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SDK2Q58EX2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SDK2Q58EX2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SDK2Q58EX2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SDK2Q58EX2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SDK2Q58EX2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SDK2Q58EX2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SDK2Q58EX2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SDK2Q58EX2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SDK2Q58EX2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SDK2Q58EX2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SDK2Q58EX2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SDK2Q58EX2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SDK2Q58EX2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SDK2Q58EX2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SDK2Q58EX2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SDK2Q58EX2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SDK2Q58EX2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SDK2Q58EX2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SDK2Q58EX2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms