Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C4orf17Q53FE4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C4orf17Q53FE4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C4orf17Q53FE4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
C4orf17Q53FE4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
C4orf17Q53FE4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
C4orf17Q53FE4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms