Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms