Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms