Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms