Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf21Q32NC0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf21Q32NC0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf21Q32NC0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf21Q32NC0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf21Q32NC0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf21Q32NC0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf21Q32NC0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms