Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP5B1Q2VPB7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP5B1Q2VPB7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
AP5B1Q2VPB7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
AP5B1Q2VPB7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP5B1Q2VPB7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP5B1Q2VPB7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AP5B1Q2VPB7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms