Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms