Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB5Q2M3G0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB5Q2M3G0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms