Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIST2H2ACQ16777 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIST2H2ACQ16777 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIST2H2ACQ16777 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIST2H2ACQ16777 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIST2H2ACQ16777 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIST2H2ACQ16777 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIST2H2ACQ16777 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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HIST2H2ACQ16777 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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HIST2H2ACQ16777 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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HIST2H2ACQ16777 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HIST2H2ACQ16777 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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