Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN1Q16512 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
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