Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1EQ15878 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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