Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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NEDD8Q15843 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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NEDD8Q15843 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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NEDD8Q15843 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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NEDD8Q15843 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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NEDD8Q15843 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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NEDD8Q15843 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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NEDD8Q15843 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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NEDD8Q15843 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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