Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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