Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ITSN1Q15811 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
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