Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
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