Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIP4Q15650 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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