Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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