Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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