Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3CQ15386 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
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