Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RABEP1Q15276 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
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