Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDK1Q15118 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDK1Q15118 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDK1Q15118 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDK1Q15118 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDK1Q15118 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDK1Q15118 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDK1Q15118 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDK1Q15118 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDK1Q15118 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDK1Q15118 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDK1Q15118 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDK1Q15118 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDK1Q15118 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDK1Q15118 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDK1Q15118 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDK1Q15118 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDK1Q15118 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDK1Q15118 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDK1Q15118 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDK1Q15118 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDK1Q15118 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDK1Q15118 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDK1Q15118 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDK1Q15118 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDK1Q15118 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PDK1Q15118 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDK1Q15118 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDK1Q15118 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDK1Q15118 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PDK1Q15118 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDK1Q15118 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDK1Q15118 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDK1Q15118 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDK1Q15118 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDK1Q15118 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDK1Q15118 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDK1Q15118 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDK1Q15118 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDK1Q15118 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PDK1Q15118 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PDK1Q15118 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDK1Q15118 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDK1Q15118 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDK1Q15118 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDK1Q15118 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDK1Q15118 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDK1Q15118 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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PDK1Q15118 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK1Q15118 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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