Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
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