Protein–RNA interactions for Protein: Q14657

LAGE3, EKC/KEOPS complex subunit LAGE3, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAGE3Q14657 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAGE3Q14657 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAGE3Q14657 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAGE3Q14657 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAGE3Q14657 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAGE3Q14657 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAGE3Q14657 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAGE3Q14657 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAGE3Q14657 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAGE3Q14657 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAGE3Q14657 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAGE3Q14657 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAGE3Q14657 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAGE3Q14657 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAGE3Q14657 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAGE3Q14657 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAGE3Q14657 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAGE3Q14657 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAGE3Q14657 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LAGE3Q14657 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LAGE3Q14657 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAGE3Q14657 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAGE3Q14657 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LAGE3Q14657 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAGE3Q14657 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAGE3Q14657 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAGE3Q14657 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAGE3Q14657 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAGE3Q14657 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAGE3Q14657 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LAGE3Q14657 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAGE3Q14657 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LAGE3Q14657 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAGE3Q14657 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LAGE3Q14657 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LAGE3Q14657 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAGE3Q14657 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAGE3Q14657 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAGE3Q14657 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAGE3Q14657 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAGE3Q14657 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LAGE3Q14657 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LAGE3Q14657 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAGE3Q14657 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAGE3Q14657 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LAGE3Q14657 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAGE3Q14657 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAGE3Q14657 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAGE3Q14657 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAGE3Q14657 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LAGE3Q14657 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAGE3Q14657 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAGE3Q14657 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAGE3Q14657 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAGE3Q14657 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAGE3Q14657 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAGE3Q14657 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAGE3Q14657 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAGE3Q14657 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAGE3Q14657 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAGE3Q14657 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAGE3Q14657 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAGE3Q14657 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAGE3Q14657 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAGE3Q14657 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAGE3Q14657 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAGE3Q14657 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LAGE3Q14657 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAGE3Q14657 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAGE3Q14657 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAGE3Q14657 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAGE3Q14657 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LAGE3Q14657 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAGE3Q14657 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LAGE3Q14657 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAGE3Q14657 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAGE3Q14657 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAGE3Q14657 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAGE3Q14657 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAGE3Q14657 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAGE3Q14657 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAGE3Q14657 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAGE3Q14657 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAGE3Q14657 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAGE3Q14657 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAGE3Q14657 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAGE3Q14657 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAGE3Q14657 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAGE3Q14657 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAGE3Q14657 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAGE3Q14657 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAGE3Q14657 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAGE3Q14657 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAGE3Q14657 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LAGE3Q14657 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAGE3Q14657 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAGE3Q14657 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAGE3Q14657 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAGE3Q14657 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAGE3Q14657 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms