Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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SEMA3AQ14563 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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