Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
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