Protein–RNA interactions for Protein: Q14156

EFR3A, Protein EFR3 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3AQ14156 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
EFR3AQ14156 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
EFR3AQ14156 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms