Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
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DDX39BQ13838 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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DDX39BQ13838 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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DDX39BQ13838 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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DDX39BQ13838 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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DDX39BQ13838 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20■□□□□ 0.79
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DDX39BQ13838 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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DDX39BQ13838 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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DDX39BQ13838 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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DDX39BQ13838 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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DDX39BQ13838 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
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