Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOFQ13790 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOFQ13790 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOFQ13790 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOFQ13790 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOFQ13790 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOFQ13790 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOFQ13790 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOFQ13790 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOFQ13790 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOFQ13790 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOFQ13790 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
APOFQ13790 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOFQ13790 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOFQ13790 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
APOFQ13790 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOFQ13790 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOFQ13790 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOFQ13790 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOFQ13790 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOFQ13790 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOFQ13790 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOFQ13790 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOFQ13790 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOFQ13790 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOFQ13790 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOFQ13790 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOFQ13790 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOFQ13790 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOFQ13790 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOFQ13790 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOFQ13790 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
APOFQ13790 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOFQ13790 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOFQ13790 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOFQ13790 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOFQ13790 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOFQ13790 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOFQ13790 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOFQ13790 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOFQ13790 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOFQ13790 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOFQ13790 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOFQ13790 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOFQ13790 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOFQ13790 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOFQ13790 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOFQ13790 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOFQ13790 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOFQ13790 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOFQ13790 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOFQ13790 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
APOFQ13790 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
APOFQ13790 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
APOFQ13790 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
APOFQ13790 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
APOFQ13790 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOFQ13790 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOFQ13790 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOFQ13790 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOFQ13790 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOFQ13790 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOFQ13790 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOFQ13790 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOFQ13790 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOFQ13790 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOFQ13790 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOFQ13790 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOFQ13790 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOFQ13790 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOFQ13790 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOFQ13790 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOFQ13790 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOFQ13790 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOFQ13790 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOFQ13790 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOFQ13790 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
APOFQ13790 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOFQ13790 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOFQ13790 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOFQ13790 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOFQ13790 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOFQ13790 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
APOFQ13790 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOFQ13790 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOFQ13790 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOFQ13790 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOFQ13790 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOFQ13790 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOFQ13790 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOFQ13790 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOFQ13790 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOFQ13790 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOFQ13790 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOFQ13790 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOFQ13790 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOFQ13790 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOFQ13790 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOFQ13790 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOFQ13790 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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